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在PCR反应早期，产生荧光的水平不能与背景明显地区别，而后荧光的产生进入指数期、线性期和终的平台期，因此可以在PCR反应处于指数期的某一点 上来检测PCR产物的量，并且由此来推断模板初的含量。为了便于对所检测样本进行比较，在real-time Q-PCR反应的指数期，首先需设定一定荧光信号的域值，一般这个域值（threshold）是以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号 （baseline），荧光域值的缺省设置是3～15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。如果检测到荧光信号超过域值被认为是真 正的信号，它可用于定义 样本的域值循环数（Ct）。Ct值的含义是：每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。研究表明，每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的 对数存在线性关系，起始拷贝数越多，Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线，因此只要获得未知样品的Ct值，即可从标准曲线上计算出该样 品的起始拷贝数。

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常用的动物检疫方法:常用的动物检疫方法有临床检查、实验室检验等方法。临床检查方法主要看动物的表现(静、动、卧、起、立、精神、食欲等)是否正常，体温、脉搏、呼吸等是否在正常生理指标范围内。实验室检验则依照农业部颁布的动物检疫操作规程规定的检疫方法和判定标准执行。①产地检疫。是指动物离开饲养产地之前的检疫。②屠宰检疫。是指在宰前、宰后及屠宰过程中，对动物及动物产品所实施的检疫。包括宰前检疫②屠宰检疫。是指在宰前、宰后及屠宰过程中，对动物及动物产品所实施的检疫。包括宰前检疫和宰后检疫两个环节。③检疫证明。是指检疫机关给检疫合格的动物、动物产品出具的法律书证。现行农业部统一监制、发放和使用的检疫证明包括《动物检疫合格证明》、《动物产品检疫合格证明》、《出县境动物检疫合格证明》、《出县境动物产品检疫合格证明》和《动物及动物产品运载工具消毒证明》5种。

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动物疫病诊断的主要内容有:一是对血、 尿、粪等进行临床常规化验;二是从流行病学角度，调查研究动物疫病流行情况，主要调查动物发病时间及地点、疫病蔓延情况、疫情来源及传播的途径与方式等;三是从病理学方面，剖检因忠传染病而死亡的畜禽尸体，查看其病理变化，或者取病料进行送检，再进一步做病理组织学方面的诊断;四是从微生物学角度，检查、坚定从患病的畜禽病料当中分离并且培养出来的病原微生物，或者是进行动物接种试验等，五是从免疫学角度，对组织或者细胞的变态反应、细胞的免疫功能及血清学反应等进行诊断。

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在动物疫病诊断中，化验室的操作较为关键，对诊断的结果有直接的影响。但是，在当前实验室操作中还存在一-些问题，如检测操作中、检测报告中未填写、不开具《检测委托书》等这些问题的存在严重影响动物疫病的诊断，不利于动物疫病的防控。因此，在今后工作中，需要对相关工作制度进行不断地完善，促使化验室的操作更加规范化、科学化;加强对实验室人员的专业培训，提高其操作水平。只有这样才能提高动物疫病检测的准确性，为我国的动物疫病防控工作做好铺垫。

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实时荧光定量pcr仪，由荧光定量系统和计算机组成，用来监测循环过程的荧光。与实时设备相连的计算机收集荧光数据。数据通过开发的实时分析软件以图表的形式显示。原始数据被绘制成荧光强度相对于循环数的图表。原始数据收集后可以开始分析。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。正常化后可以设定域值水平，这就是分析荧光数据的水平。

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大部分分子诊断实验室的核心技术都主要集中在检测特异性、相对较短的DNA或RNA片段上。该技术能诊断传染性疾病、鉴别影响药物代谢的特殊基因变异型或检测与疾病有关的基因，如与癌症有关的基因。这些检测的核心是实时定量聚合酶链反应（PCR）、转录调节扩增（TMA）、靶向扩增和信号扩增等类似技术的应用。桑格排序和DNA片段分析或采用毛细电泳法的凝胶法都是分子诊断实验室的关键技术，但他们通常还包括检测过程中的扩增步骤。为了能顺利应用那些采用DNA和RNA来诊断疾病的检测，分子诊断实验室须要使用定义明确的工作流程，从而得到稳定的、有效的结果，而当前已存在能帮助诊断实验室实现每个工作流程流水化的特殊工具。